根據(jù)財政部稅務(wù)總局海關(guān)總署公告2019年第39號第八條規(guī)定，同時符合納稅信用等級為A級或者B級、自2019年4月稅款所屬期起，連續(xù)六個月（按季納稅的，連續(xù)兩個季度）增量留抵稅額均大于零，且第六個月增量留抵稅額不低于50萬元等列舉的五項條件，可以向主管稅務(wù)機關(guān)申請退還增量留抵稅額。

　　所以，滿足上述條件的分支機構(gòu)才可以申請增值稅留抵退稅。

　　又根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于明確納稅信用管理若干業(yè)務(wù)口徑的公告》（國家稅務(wù)總局公告2015年第85號）第一條規(guī)定，《信用管理辦法》的適用范圍為：已辦理稅務(wù)登記（含“三證合一、一照一碼”、臨時登記），從事生產(chǎn)、經(jīng)營并適用查賬征收的獨立核算企業(yè)、個人獨資企業(yè)和個人合伙企業(yè)。

　　可見，非獨立核算分支機構(gòu)作為獨立核算企業(yè)的一個部門，之前未作為獨立的納稅主體參與納稅信用評價。此時，非獨立核算的分支機構(gòu)無法申請增值稅留抵退稅。

　　但，為深入貫徹落實“放管服”改革精神，國家稅務(wù)總局公告2020年第15號第一條規(guī)定，自2020年11月1日起，非獨立核算分支機構(gòu)可以根據(jù)自身情況，自愿參與納稅信用評價。此處的非獨立核算分支機構(gòu)是指由企業(yè)納稅人設(shè)立，已在稅務(wù)機關(guān)完成登記信息確認且核算方式為非獨立核算的分支機構(gòu)。非獨立核算分支機構(gòu)參評后，2019年度之前的納稅信用級別不再評價，在機構(gòu)存續(xù)期間適用國家稅務(wù)總局納稅信用管理相關(guān)規(guī)定。

　　綜上，貴司設(shè)立的非獨立核算的分支機構(gòu)需要參與納稅信用評價后，如果符合申請退還增量留抵稅額條件的，那么可以享受增量留抵退稅政策。

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　　相關(guān)規(guī)定：

　　《財政部稅務(wù)總局海關(guān)總署關(guān)于深化增值稅改革有關(guān)政策的公告》（財政部稅務(wù)總局海關(guān)總署公告2019年第39號）

　　八、自2019年4月1日起，試行增值稅期末留抵稅額退稅制度。

　?。ㄒ唬┩瑫r符合以下條件的納稅人，可以向主管稅務(wù)機關(guān)申請退還增量留抵稅額：

　　1.自2019年4月稅款所屬期起，連續(xù)六個月（按季納稅的，連續(xù)兩個季度）增量留抵稅額均大于零，且第六個月增量留抵稅額不低于50萬元；

　　2.納稅信用等級為A級或者B級；

　　3.申請退稅前36個月未發(fā)生騙取留抵退稅、出口退稅或虛開增值稅專用發(fā)票情形的；

　　4.申請退稅前36個月未因偷稅被稅務(wù)機關(guān)處罰兩次及以上的；

　　5.自2019年4月1日起未享受即征即退、先征后返（退）政策的。

　　《國家稅務(wù)總局關(guān)于納稅信用管理有關(guān)事項的公告》（國家稅務(wù)總局公告2020年第15號）

　　一、非獨立核算分支機構(gòu)可自愿參與納稅信用評價。本公告所稱非獨立核算分支機構(gòu)是指由企業(yè)納稅人設(shè)立，已在稅務(wù)機關(guān)完成登記信息確認且核算方式為非獨立核算的分支機構(gòu)。

　　非獨立核算分支機構(gòu)參評后，2019年度之前的納稅信用級別不再評價，在機構(gòu)存續(xù)期間適用國家稅務(wù)總局納稅信用管理相關(guān)規(guī)定。