根據(jù)《個人所得稅法實施條例》第十四條的規(guī)定，勞務報酬所得、稿酬所得、特許權使用費所得，屬于一次性收入的，以取得該項收入為一次；屬于同一項目連續(xù)性收入的，以一個月內(nèi)取得的收入為一次。

　　由于貴司支付給該施工人員的費用屬于兩個項目，故，分次支付的勞務費需要作為兩次收入進行申報個人所得稅。

　　另外，根據(jù)《國家稅務總局關于個人所得稅偷稅案件查處中有關問題的補充通知》（國稅函發(fā)1996602號）第四條規(guī)定，關于勞務報酬所得“次”的法規(guī)個人所得稅法實條例第二十一條法規(guī)“屬于同一項目連續(xù)性收入的，以一個月內(nèi)取得的收入為一次”，考慮屬地管轄與時間劃定有交叉的特殊情況，統(tǒng)一法規(guī)以縣（含縣級市、區(qū)）為一地，其管轄內(nèi)的一個月內(nèi)的勞務服務為一次；當月跨縣地域的，則應分別計算。

　　綜上，由于A項目地和B項目地跨區(qū)域，所以應在兩地分別代扣代繳個人所得稅。等到個人所得稅匯算清繳時，再將兩次收入并入到綜合所得中進行匯算。